处理农民施工阻工的问题，可以采取以下措施：
如果村民无理阻挠施工，尤其是当阻工行为导致现场停产停工并造成损失时，应迅速报警请求警方协调处理。警方可以根据《治安管理处罚法》对阻工者进行警告或罚款，情节较重的可拘留并处罚款，聚众闹事的要追究首要分子的刑事责任。
在报警的同时，可以尝试与村民代表进行协商，寻求和平解决纠纷的途径。通过友好沟通，可能能够化解矛盾，避免进一步的冲突。
如果协商无果，村民仍然阻挠施工，可以通过法律途径解决。可以向法院起诉要求排除妨碍。对于非法施工的阻工行为，虽然村民的行为可能不直接构成违法，但严重扰乱公共秩序时，警方仍可介入并采取相应措施。
在处理阻工事件时，应尽可能收集相关证据，如现场照片、视频、证人证言等，以便在需要时提供给警方或法院作为处理依据。
如果情况复杂，建议咨询专业律师，获取更具体的法律建议和帮助。律师可以根据具体情况提供专业的法律意见和代理服务。
通过以上措施，可以有效地处理农民施工阻工的问题，维护施工秩序和公共利益。
