运管部门扣车的时间通常是一个月，最长不超过两个月。在扣车时，运管部门需要给车主开具暂扣凭证，否则不能扣车。如果车主能够证明不存在非法营运，可以在暂扣车辆后通过提起复议、诉讼等正当途径取回车辆。
此外，根据《中华人民共和国行政强制法》第二十五条，查封、扣押的期限不得超过三十日，情况复杂的，经行政机关负责人批准，可以延长，但延长期限不得超过三十日。因此，运管部门在扣留车辆时，必须在法律规定的期限内完成相关手续，并及时通知车主前来处理。
