当发现个人所得税被少扣时，可以采取以下步骤进行补缴：
登录个人所得税网上申报系统，查看自己的纳税情况，核实是否有少扣税款及其原因。
联系当地税务部门，向税务机关报告情况，申请补缴税款。准备好发票、凭证等相关资料，按照补缴税款的要求准备相关文件。
确认应补税额。通过年度汇算来确定是否需要补税及具体金额。如果对预填服务中的数据有疑问，可以选择标准申报表办理年度汇算。
选择补税方式。税务机关提供了多种便捷的补税渠道，包括网上银行、办税服务厅POS机刷卡、银行柜台、非银行支付等方式缴纳应补税款。
进行更正申报。如果是因为适用所得项目错误或者扣缴义务人未依法履行扣缴义务，造成纳税年度内少申报或者未申报综合所得，纳税人应当依法据实办理年度汇算。如果是企业投资人或个体工商户业主，可通过自然人电子税务局WEB端进行申报，申报流程同正常申报。
及时补缴税款，并保存关于补缴税款的相关凭证。根据税务机关要求，及时补缴税款，并保存关于补缴税款的相关凭证。
定期查看个人所得税网上申报系统，确保个税支付得到及时确认。
建议：
提前准备好所有需要的文件和资料，确保补缴过程顺利。
如果对补缴流程有疑问，可以直接联系当地税务机关获取帮助。
补缴税款后，务必妥善保存相关凭证，以备后续查询或核查。
